Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms