Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLMP48507 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms