Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RANGAP1P46060 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms