Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms