Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms