Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FLT4P35916 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FLT4P35916 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FLT4P35916 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FLT4P35916 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FLT4P35916 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FLT4P35916 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FLT4P35916 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FLT4P35916 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FLT4P35916 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FLT4P35916 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLT4P35916 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLT4P35916 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT4P35916 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT4P35916 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT4P35916 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT4P35916 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT4P35916 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT4P35916 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT4P35916 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT4P35916 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT4P35916 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT4P35916 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT4P35916 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT4P35916 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT4P35916 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT4P35916 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT4P35916 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT4P35916 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT4P35916 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT4P35916 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT4P35916 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT4P35916 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT4P35916 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT4P35916 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT4P35916 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT4P35916 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT4P35916 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT4P35916 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT4P35916 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT4P35916 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT4P35916 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms