Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms