Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GJA4P35212 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GJA4P35212 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GJA4P35212 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
GJA4P35212 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA4P35212 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms