Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms