Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms