Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms