Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms