Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GIFP27352 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GIFP27352 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIFP27352 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIFP27352 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GIFP27352 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms