Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms