Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRHP20396 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHP20396 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHP20396 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRHP20396 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRHP20396 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRHP20396 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRHP20396 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRHP20396 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRHP20396 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRHP20396 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRHP20396 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRHP20396 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRHP20396 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRHP20396 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRHP20396 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRHP20396 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRHP20396 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHP20396 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRHP20396 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRHP20396 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRHP20396 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRHP20396 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
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