Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VCLP18206 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VCLP18206 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VCLP18206 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCLP18206 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCLP18206 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCLP18206 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VCLP18206 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms