Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms