Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms