Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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UBL4AP11441 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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