Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI4P10075 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI4P10075 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI4P10075 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI4P10075 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI4P10075 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI4P10075 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI4P10075 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI4P10075 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI4P10075 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI4P10075 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI4P10075 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI4P10075 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GLI4P10075 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms