Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GLI3P10071 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GLI3P10071 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GLI3P10071 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI3P10071 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GLI3P10071 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GLI3P10071 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GLI3P10071 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GLI3P10071 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GLI3P10071 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GLI3P10071 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GLI3P10071 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GLI3P10071 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GLI3P10071 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GLI3P10071 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GLI3P10071 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GLI3P10071 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GLI3P10071 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GLI3P10071 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GLI3P10071 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GLI3P10071 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLI3P10071 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLI3P10071 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms