Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV3-11P04433 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms