Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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SCN2BO60939 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SCN2BO60939 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SCN2BO60939 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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