Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PRAMEF10O60809 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PRAMEF10O60809 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF10O60809 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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