Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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