Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms