Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms