Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-1B6SEH8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms