Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms