Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms