Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAXBP1Q9Y5B6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms