Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA11Q9UKX5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms