Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms