Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPARGC1AQ9UBK2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPARGC1AQ9UBK2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms