Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA13Q9P0J0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms