Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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