Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms