Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms