Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms