Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms