Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN4Q9NRL3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRN4Q9NRL3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRN4Q9NRL3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
STRN4Q9NRL3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRN4Q9NRL3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRN4Q9NRL3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRN4Q9NRL3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRN4Q9NRL3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms