Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms