Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REEP4Q9H6H4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms