Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms