Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms