Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms