Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms