Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD2Q9BTF0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
THUMPD2Q9BTF0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
THUMPD2Q9BTF0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
THUMPD2Q9BTF0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
THUMPD2Q9BTF0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
THUMPD2Q9BTF0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
THUMPD2Q9BTF0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
THUMPD2Q9BTF0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
THUMPD2Q9BTF0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
THUMPD2Q9BTF0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
THUMPD2Q9BTF0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
THUMPD2Q9BTF0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD2Q9BTF0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD2Q9BTF0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD2Q9BTF0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD2Q9BTF0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD2Q9BTF0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD2Q9BTF0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD2Q9BTF0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD2Q9BTF0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms