Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms