Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TXNDC17Q9BRA2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms